Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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