Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XntrpcF8VQM8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms