Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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