Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Il1bos-202ENSMUST00000156601 2425 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Slc17a1-202ENSMUST00000110413 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Acox3-201ENSMUST00000068563 3386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Disp1-202ENSMUST00000171366 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Dusp3-203ENSMUST00000107173 4311 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Il16-201ENSMUST00000001792 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Zbtb44-206ENSMUST00000217092 2472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pde6h-202ENSMUST00000137768 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm38056-201ENSMUST00000193928 5027 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Zfp536-206ENSMUST00000176205 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm20743-202ENSMUST00000194322 2830 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms