Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms