Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17333C6EQI3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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