Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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