Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf3B2RQG2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms