Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms