Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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H2-M5A7VMS3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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H2-M5A7VMS3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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H2-M5A7VMS3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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H2-M5A7VMS3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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H2-M5A7VMS3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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