Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms