Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms