Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms