Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm11A2AGX3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms