Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms