Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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