Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms