Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms