Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms