Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Prkab1Q9R078 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prkab1Q9R078 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Prkab1Q9R078 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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