Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdcQ9QW08 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms