Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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