Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ap3m1Q9JKC8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ap3m1Q9JKC8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ap3m1Q9JKC8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ap3m1Q9JKC8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ap3m1Q9JKC8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ap3m1Q9JKC8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ap3m1Q9JKC8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ap3m1Q9JKC8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ap3m1Q9JKC8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ap3m1Q9JKC8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ap3m1Q9JKC8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ap3m1Q9JKC8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ap3m1Q9JKC8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ap3m1Q9JKC8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ap3m1Q9JKC8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ap3m1Q9JKC8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ap3m1Q9JKC8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms