Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms