Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hmg20aQ9DC33 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hmg20aQ9DC33 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hmg20aQ9DC33 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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