Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S3

Arfgap3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap3Q9D8S3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arfgap3Q9D8S3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms