Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkbh4Q9D8F1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms