Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms