Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gabra4Q9D6F4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra4Q9D6F4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.3 ms