Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Fndc8Q9D2H8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Fndc8Q9D2H8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Fndc8Q9D2H8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms