Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 253.9 ms