Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms