Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms