Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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