Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Tmed5Q9CXE7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms