Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms