Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znhit3Q9CQK1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms