Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Chmp3Q9CQ10 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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