Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Commd4Q9CQ02 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms