Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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