Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms