Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hps4Q99KG7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Hps4Q99KG7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hps4Q99KG7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hps4Q99KG7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Hps4Q99KG7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hps4Q99KG7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hps4Q99KG7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hps4Q99KG7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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