Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan1Q99J59 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms