Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms