Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc8b1Q925Q3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms