Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms