Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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