Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dkk4Q8VEJ3 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms