Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE47

Uba5, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba5Q8VE47 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba5Q8VE47 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms