Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8VCE4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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